El premio Manuel J. Bustamante se instituyó en el año 2008 por conmemorar los 50 años de la Fundación. Este premio tiene carácter rotativo y se otorga en los ámbitos: jurídico, histórico y socio-económico.

En el 2008, Felipe Ortiz de Zevallos recibió el primer premio de la Fundación Manuel J. Bustamante en el área socioeconómica.